这是一段攻壳灵活队成立前夜不为人知而又影响深远的故事。2027年6月6日的一天，隶属陆军秘要部队501机关的真室中佐（宫内敦士配音）在闹市街头被人杀戮，此前他曾陷入军械生意的贿赂丑闻不得脱身，他对死亡背后自然隐藏着无数谜团。阴雨…