反恐特战队队长钟原在执行任务中，枪杀猛犸组织二把手招来复仇。在拯救老婆赵欣的行动中钟原被注入病毒备受摧残。DK生物公司集团董事长江寒邀约初恋、生化专业的高材生的赵欣以及父亲参加公司“有益菌”研究。反恐指挥中间根据T国请求选派“专家”潜入公司。痛失爱子的赵欣自动请缨“退出现役”、深入虎穴。连续不断的恐怖事务，使“新纪元计划”逐渐浮出水面。被痛苦摧残的钟原带领乔大鹏、麦萌萌等特战队员绝地出击，在妻子赵欣和五年前“失踪”的队友陆豪的协助下，顺利破碎了恐怖组织连环诡计和生化袭击，掀开了江寒以“有益菌”为媒介制造病毒的实际面目。
本剧充分呈现了武警特战分队思想政治十分过硬、专业的素质十分过硬、作战作风十分过硬的时期风采，突显了召之即来、来之能战、战之必胜的强大反恐战斗能力，让武警特战分队“国际一流水平反恐特战劲旅”的形象立了起来。
