1949年，国民党制定了一份“秘杀名单”，里面开列了有起义趋向国民党军高级军官，及国统区的爱国民主人士数十人。共产党中央命令潜伏在国民党国防部的地下党员沈剑秋搞到名单表，以保护这批人士。国防部保密局上海中央局局长严敬尧、副局长方汝州、保密局女特工叶梦馨、委员长侍从室特工林怡等人为“秘杀行动”和“秘杀名单”各怀鬼胎。叶梦馨自小被沈剑秋的母亲收留，她深爱沈剑秋；而沈剑秋爱的是女军医夏冰；林怡所爱的画家陶公亮是国民党桂系安插在中共上海地下党内部的卧底，而陶公亮的恋人是沈剑秋的小妹沈若兰。这份“名单表”藏在国民党保密局深处，中共、保密局中有心投共的人员、青帮三家盯着，经过激动人心的激烈争夺，最终，“名单表”上的大部分人得到了及时的保护。
《秘杀名单》剑走偏锋，一转过去谍战片中大量细致、繁杂的内心戏路等，继而以极尽描摹的节奏呈现故事发展。演员们也放弃过多的内心戏，以行动和语言来推动整个故事，让观众也不消再跟着剧中人物稍显过多的内心戏而纠结。从现在收视效果来看，《秘杀名单》从传统的谍战片中突出重围，以独特的故事节奏，波澜起伏的故工作节独具一格，开创了谍战片的一种全新模式。
