在天空与人类世界之海相连的深海中，有“其他人”掌管着人类世界万物的运行规律。住在“神之围楼”的女孩“春”在16岁生日那天变成了海豚。她被网困在海里。一个男孩儿跳进了深海，因为他救了她而死。作为回报，她需要帮助孩子在自己的世界里的灵魂——一条拇指大小的小鱼——长成比鲸鱼还大的鱼，然后返回大海。经过种种艰难险阻，男孩死后终于重生，但这一过程不竭违背“天主”的世界法则，引发各种灾难。
《大鱼海棠》中的人物神秘莫测，展现了东方独有的古典神秘气质。创作者们也非常注重影片中细节的刻画，创造出一个完整而饱满的东方幻想世界。其故事主题独特，样本效果惊人，制作经验传奇坎坷，影片中人物的古代服饰、遍地的中国红、福建土楼的独特风格，都带来了浓浓的“中国风”。这部作品首要运用二维动画来描绘壮丽的奇观，这在三维动画时代也是非常珍贵的
