密裁第十八集团军高级参议、中共党员宣侠父，此举引发中共强烈抗议。迫于舆论压力，国民党被迫在西安成立破反专署，调查宣侠父失踪案。中共地下党员、原中统特工武仲明，成为国共双方共同认可的破反专员。武仲明领衔的破反专署，集结了西安军、警、特和八路军西安办事处各路人马,敌中有我，我中有敌，扑朔迷离，调查之旅甫一启程即步步陷阱、危机四伏！武仲明彻查宣侠父案两个月间，不但是刀锋上的对决，也是人道的较量。在地下党组织引领下，正义同道前赴后继追寻下，武仲明终于查明真相，拿到了密裁宣侠父手谕。迫于证据确凿，蒋介石不能不向中共认账，自吞苦果 。
《密查》在保留谍战剧针锋相对的传统格局的基础上，融入了侦探推理元素，利用案件的悬疑感和推理的抽丝剥茧，增强故事的精彩程度。在人物塑造上，该剧在固定范式的框定下，采用最贴近人道的设定与非全知的视角，增添人物的魅力。
